小麥D基因組完整圖譜首繪成功

小麥D基因組完整圖譜首繪成功

2022-04-04 08:10:42

分類:基因組

據中國農科院最新消息,該院作物科學研究所研究員賈繼增領銜的研究團隊,在小麥D基因組測序研究中,揭示了轉座子(TE)在小麥基因組中的重要功能,完成了染色體級別的D基因組精細圖譜的繪制,并首次獲得一個完整的整合圖譜。相關研究論文20日在線發表于《自然·植物》期刊上。賈繼增介紹,小麥是…

高質量基因組揭示類人猿之間的差異

高質量基因組揭示類人猿之間的差異

2022-04-03 17:45:42

分類:基因組

對于某些類人猿高質量基因組已被測序組裝採用最先進的工具。該組件提供人類和他們最親密的進化親屬之間的無偏的比較。許多進化生物學是出于原則,你無法理解的一種不與他人比較。在19世紀的博物學家相比人類和其他類人猿的解剖,它變得清晰,這些物種有許多共同的特征,從共同的祖先進化而來。最近,…

三分鐘,了解MutMap成長記

三分鐘,了解MutMap成長記

2022-04-03 16:52:01

分類:基因組

MutMap野生型親本通過EMS誘變得到突變型,篩選感興趣的突變體與野生型親本雜交,得到F1代,再自交得到F2代,在F2代中選擇突變個體進行混池測序,然后與親本參考基因組進行比對,計算每個SNP位點對應的index值,具體原理見圖1。註:SNP-index值是某個位點含有SNP的…

深入解析如何將超大基因組組裝到染色體水平

深入解析如何將超大基因組組裝到染色體水平

2022-04-03 16:27:42

分類:基因組

目前蠑螈基因組組裝工作的重大突破表明超大基因組組裝的難點已被新平臺和新技術攻克,后續將有更多受限于以往技術瓶頸而無法有效組裝的基因組報導出來。盡管越來越多的高難度基因組完成了組裝,但染色體水平的基因組構建仍是一個充滿挑戰的領域。首先染色體水平的基因組序列非常有價值,對于大型基因組…

華大基因完成DNA「漏洞」填補工作

華大基因完成DNA「漏洞」填補工作

2022-04-03 15:35:22

分類:基因組

日期:2012-01-31來源:未知摘要:世界最大規模的基因組學研究中心——深圳華大基因研究院和基因組光學圖譜技術的獨家供應商OpGen公司成功地合作完成人類基因組現有的序列中「漏洞」的填補工作。雙方將致力于推廣基因組dna測序技術正取得突飛勐進的發展,研究人員可以花費更低的成本…

「再生能力」背后的遺傳學基礎揭示

「再生能力」背后的遺傳學基礎揭示

2022-04-03 15:00:20

分類:基因組

擁有「再生能力」的美西螈圖片來源:《自然》雜志網站英國《自然》雜志近日發表了兩篇基因學論文,歐洲兩組團隊分別報告了美西螈和真渦蟲的基因組,揭示了神秘「再生能力」背后的遺傳學基礎。其中美西螈的320億個鹼基對,是目前組裝出的最大基因組。美西螈全部肢體都可以再生,而真渦蟲甚至可以在被…

6年前發布的一款U盤DNA測序儀,如今有了新用途

6年前發布的一款U盤DNA測序儀,如今有了新用途

2022-04-03 14:22:12

分類:基因組

可攜式DNA測序儀公司OxfordNanoporeTechnologies在2012年發表了相當于一般U盤大小的USB測序設備,其尺寸比一副紙牌更小。盡管具有創新性,但也存在不少問題——包括有一點延遲,有時也不太準確。該測序儀可從雙股螺結構中取得單鏈DNA,并經由蛋白質孔傳送少量…

科學家首次用手持「USB設備」,對人類基因組進行測序

科學家首次用手持「USB設備」,對人類基因組進行測序

2022-04-03 13:27:17

分類:基因組

科學家本周報導說,他們首次使用口袋大小的測序儀對人類基因組進行了測序和組裝。研究人員利用MinION納米孔測序儀完成了他們的基因分析,閱讀了近千億個鹼基對的數據并分析了大量的DNA。該產品主要客戶是科學家,但成本只有一千美元。其他DNA測序儀大約是一個標準的復印機大小。人類基因組…

科學家實現用手持USB設備對人類基因組進行測序

科學家實現用手持USB設備對人類基因組進行測序

2022-04-03 12:52:57

分類:基因組

科學家們說,他們本周首次使用口袋大小的測序儀對人類基因組進行了測序和拼接。研究人員利用MinION納米孔測序儀完成了這件事,讀出了近千億個鹼基對的數據并分析了大量的DNA。該產品主要針對的群體是科學家,但是成本卻只有一千美元。其它類型的DNA測序機的尺寸大約是一個標準的辦公復印機…

迄今最連續人類基因組組裝完成

迄今最連續人類基因組組裝完成

2022-04-03 12:29:54

分類:基因組

英國《自然·生物技術》雜志29日在線發表了一項基因組學研究成果:英國科學家團隊利用一個口袋大小的納米孔測序裝置,從頭組裝出人類基因組,這是迄今為止最連續的人類基因組組裝,而且只用了單一測序技術。這項研究同時成功地分析了過去最先進的測序方法也分析不出的人類基因組區域。理解和解讀人類…

谷歌大腦發布DeepVariant,用深度學習實現精準基因測序

谷歌大腦發布DeepVariant,用深度學習實現精準基因測序

2022-04-03 11:37:59

分類:基因組

在許多科學領域,特別是基因組學領域里,重大突破常常歸功于新技術的應用。例如誕生于1977年的桑格測序法(Sangersequencing),是世界上第一個測定人類DNA序列的方法;后來的微陣列晶片技術(microarraytechnologies)能夠進行大規模全基因組實驗。新的…

PacBio技術破譯 「筑壩高手」 海貍的基因組

PacBio技術破譯 「筑壩高手」 海貍的基因組

2022-04-03 11:10:15

分類:基因組

在建筑學方面,海貍筑壩的高超能力給了人類不少啟示。在生物學方面,人類又能從海貍基因組中獲得哪些啟示呢?近日,加拿大的團隊測序并分析了加拿大海貍(Castorcanadensis)的基因組。他們在《G3:Genes,Genomes,Genetics》雜志上報導了這項研究的成果。多倫…

清華揭示大量基因組「暗物質」功能證據

清華揭示大量基因組「暗物質」功能證據

2022-04-03 10:35:35

分類:基因組

傳統研究認為,人類所有的生命活動是由約2~3萬個蛋白質編碼基因所支配(約占2%人類基因組)。超過95%的人類基因組并不編碼蛋白質基因,而是構成了生命「暗物質」——非編碼RNA。這些數目龐大的非編碼RNA由于既不編碼蛋白質,又缺乏生物學功能的遺傳學證據,一直被很多科學家認為是真核生…

Nature系列綜述:化學基因組文庫在藥物篩選中的作用

Nature系列綜述:化學基因組文庫在藥物篩選中的作用

2022-04-03 10:12:09

分類:基因組

表型篩選結合行業偏好的靶標為基礎的方法,促使創新的化學生物學技術的發展,能夠促進識別新的治療目標,加速藥物的發現。一個化學基因組文庫是一個選擇性的小分子藥物的集合,并從這樣的組合看在表型篩選是否命中。這表明注釋的目標,或藥物的靶標可能包含在正干擾的可觀察到的表型中。在2017年1…

中國遺傳學會基因組編輯分會正式成立

中國遺傳學會基因組編輯分會正式成立

2022-04-03 09:36:08

分類:基因組

健康預報臺前沿資訊:北京近日,中國遺傳學會基因組編輯分會正式成立。這是中國首個以基因組編輯為核心的學術團體,集合了中國最頂尖的基因組編輯專家。成立大會三次開放報名,三次一小時內爆滿。就連轉播的分會場,都擠滿了聞信前來的生物醫學工作者,學生,記者及其他熱心人士。從現場的火爆程度,我…

劉小樂——「欲窮千里目,更上一層樓」(八)

劉小樂——「欲窮千里目,更上一層樓」(八)

2022-04-03 09:13:59

分類:基因組

欲實時把握基因組編輯/合成生物學理論,技術和應用的最新進展,請參加第一屆基因組編輯/合成生物學的理論和應用研究研討會(2018年6月8-10日,上海)。點擊文末「閱讀原文」,即可註冊第一屆基因組編輯/合成生物學的理論和應用研究研討會(2018年6月8-10日,上海)。劉小樂劉小樂…

探索與發現~洞察細菌世界!1003種系統發育不同的細菌和古細菌參考基因組Nature Biotech

探索與發現~洞察細菌世界!1003種系統發育不同的細菌和古細菌參考基因組Nature Biotech

2022-04-03 08:49:58

分類:基因組

一抔土壤中的微生物數量超過了銀河系中星星的數量,但是研究人員更少了關于地球上的星星數量,因為他們最近才有了深入探索剛下的工具?,F在美國能源部聯合基因組研究所(DOEJGI)科學家科學家科學家科學研究所科學用戶設施辦公室的科學家已經邁出了決定性的一步,以揭露地球的微生物多樣性。在2…

1000 個新參考基因組!

1000 個新參考基因組!

2022-04-02 17:55:01

分類:基因組

「細菌和古細菌是地球上最龐大的居民,」該文章的通訊作者Kyrpides說?!杆鼈円呀浾鞣说厍虻母鱾€角落,它們用各種酶和生物化學在最嚴酷的環境中繁衍生息?!姑绹茉床繉@群多樣的生物感興趣。因為微生物在調節地球生物-地球-化學循環中起重要作用,例如控制海陸營養物質循環等。通過基因…

3D基因組時代已到來,8點基礎需知~

3D基因組時代已到來,8點基礎需知~

2022-04-02 17:28:30

分類:基因組

3D基因組時代關于「3D」大家都不陌生,鼻祖級別的3D電影《阿凡達》、火熱的3D室內裝修及造福人類的3D列印器官技術,現在3D的熱潮已席卷科研及健康領域。繼人類基因組計劃完成后,科研界逐漸認識到基因組信息分析解讀的重要性。隨著3D熱潮襲來,在未來我們會獲取到不同物種、不同器官基因…

浙大高分論文解讀:異源多倍體芥菜基因組de novo組裝

浙大高分論文解讀:異源多倍體芥菜基因組de novo組裝

2022-04-02 17:05:28

分類:基因組

導讀:這篇文章是浙江大學聯合好幾個單位一起做的關于異源四倍體芥菜基因組的denovo組裝研究,9月6日發表在NatureGenetics上,使用的是二代測序和三代測序相結合的方法,得到了一個高質量的芥菜基因組,方法值得參考,對于做植物育種的研究也很有意義。概述蕓薹屬植物包括3個二…

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